Matthias Weicker studierte Violoncello an der Hochschule für Musik in Dresden bei Ernst L. Hammer, dem Solo-Cellisten der Staatskapelle Dresden.
Ab September 1986 war er Solo-Cellist der Bühnen der Stadt Nordhausen, seit der Fusion mit dem Loh-Orchester 1991 ist Matthias Weicker stellvertretender Solo-Cellist im Loh-Orchester Sondershausen. Mit Kollegen des Loh-Orchesters spielt er außerdem im Sondershäuser Streichquartett sowie im Nordhäuser Flötenquartett.